635 5 11 F 635 39 45 1162 36 94.33
aaatatttgtctgttacagatggaacagtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacac
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
aaatatttgactgttacagatggaacagtgaagcgatacaacgatgcnaaaaaagagtggggattcacac
aattgatttctcttccaacattctacaacgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttgg
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aattgatttctcttccaacattctacaacgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttgg
tgctgagatcttcatcgttaacccgacagaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccagac
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
tgctgagatcttcatcgttaacccgacagaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaac
aatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgattttc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
aatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttc
tcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcact
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||
tngttggagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcact
tccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaacgcagttgctacaaacacttggggagcggttaat
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
tccaatcttcctatatgctcaaggccataaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaat
ctgcggttaaagaatcaacgaag-tactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattgga
||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||
ctgcggttaaagaatcaacgaagctcc-aaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcga
agcggttatggtgtgggagtgaacaatatcatactgttag-ctgatttaaacgatgcatcaaaaggatat
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | | | ||  |||| |||||||||||||| |||
agcgattatggtgtgggagtgaacaatataatattgat-gtcagagctaaaagatgcatcaaaagggtat
ttggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaaggtctctataaccaacatcgtctccgctt
 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||
atggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaaggtctctgtgacaaacatagtctccgttt
aaatatc
|||||||
aaatatc
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64
565 79 59 F 566 1495 2 1020 37 93.46
gccggatttggtttgtatccaacgttgttttgtttttctttcaataatctcatagatcttat-gttggtg
||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  |||| ||| |||| | ||| |  ||| | |||||  
gccgg-tttggtttgtncccaacgttg-tttggntttccttcnataaccccatggnccttntggttgg-n
ataatggtttaggtgatttttcgc-ttaaaga-tctttattatccaattcgatcttttgagttt-gagat
 |||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||  ||||| | |||
ntaatggtttaggngttttttcgcattaaagact-tttattanccaattcgacctttnnagtttggggat
ttgc-aggaatcaa-tttagagatttgcatc-ttaagttgaagaaaagaagaagttttcgttgcatatta
||||  ||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
ttgcngggattcaattttggaga-ttgcatcnttaagttgaag-aaagaagaagttttcgttgcatatta
atattgcccttagctgctaagtttttatctggaagttcgattggtttgtttaaggtgaaacccagaagaa
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
atattgcccttagctgctaagtttttatctggaagttcgattggtttgtttaaggtgaaacccagaagaa
tcaaacttgctttcattatcaatgttgatttttctcaccggaatcaatctcagacggcaaaggaagatgt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tcaaacttgctttcattatcaatgttgatttttctcaccggaatcaatctcagacggcaaaggaagatgt
cggaaatgcttttagattactcatccaaacgtgtgctgtgttgttttcagctgttgacacgtaagattgg
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cggaaatgcttttagattactcatccaaacgtgtgctgtgttgttttcagctgttgacacgtaagattgg
ttggagccacaatatcagttcttcatctttaagcaatgttcttggactcatttaggacttcaaatgttct
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ttggagccacaatatcagttcttcatctttaagcaatgttcttggactcatttaggacttcaaatgttct
tgtaatctcagtgtatgttgggcttttggttttttagcccatgtatggttggttaacgttaataagattt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tgtaatctcagtgtatgttgggcttttggttttttagcccatgtatggttggttaacgttaataagattt
tccacttatgag
||||||||||||
tccacttatgag
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 53/64, seed_on_end
728 5 11 F 732 16 129 1307 51 93.01
aaatatttgtctgttacagatggaacagtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacac
||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||  ||
aaatatttgactgttacagatggcttagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggac
aattgatttctc-ttccaacattctacaacgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttg
|||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||
aattgattcctcgat-caacattctacaacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttg
gtgctgagatcttcatcgttaacccgacagaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaga
||||||||||||| || ||||| ||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
gtgctgagatctttattgttaaaccggctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaa
caatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatttt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
caatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatntt
ctcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcac
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ctcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcac
ttccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaacgcagttgctacaaacacttggggagcggttaa
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
ttccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaa
tctgcggttaaagaatcaacgaagtactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattgga
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tctgcggttaaagaatcaacgaagtactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattgga
agcggttatggtgtgggagtgaacaatatcatactgttagctgatttaaacgatgcatcaaaaggatatt
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
aacggttatggtgtgggagtgaacaatatcatactgttagctgatttaaacgatgcatccaaaggatatt
tggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaaggtctctataaccaacatcgtctccgctta
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaaggtctctataaccaacatcgtctccgctta
aatatctgcacttctttgtctacgatcaatcaaccttatgaataaagagatatttgat--ga-g--tttg
||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||| ||  || |  ||||
aatatctgcncttctttgtctacnancaatccaccttatgaataaaaaaat-tttaatttgatgaatttg
taataagaaaacgttaatgtttgtgaattgtgaa
| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||
ttataanaaaactttaatgtttgttaaatgtgaa
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/45
539 3 71 F 538 6 71 972 35 93.50
cgcgaacgaagggtacnttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcat-cgttaacccgac
|||||| ||||||||| ||||| | |||    ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||
cgcgaangaagggtaccttgtgnangacnnnncttctttnggtgctganatcttcatgcgntancccgac
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccgaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
||||| ||   | | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
agaaanacnnnananagtcncattcatatcnnaccctccnaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagattag
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagattag
gatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaat
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccc-gattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaat
atcatattgatgtcagaagctaaaagatgcatcnaaa-gggtatatggtgaatgatgccattatcttttg
|| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
ataatattgatgtcaga-gctaaaagatgcatccaaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttt-g
aaactgaaatggttaaggtctctgtgaacaa-catantctccncttaaatat
|| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||
aagctgaaatggttaaggtctctgtga-caaacatagtctccgtttaaatat
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 30/64
610 3 0 F 607 39 72 1163 18 97.04
gtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gtgaagcgatacaacgatgcnaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
acgcgaacgaagggtacnttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
acgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccgaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagattag
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctngttggagaccgatactggagactag
gatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaat
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccc-gattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaat
atcatattgatgtcagaagctaaaagatgcatcnaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttttga
|| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
ataatattgatgtcaga-gctaaaagatgcatcaaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttt-ga
aactgaaatggttaaggtctctgtgaacaa-catantctccncttaaatat
| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||
agctgaaatggttaaggtctctgtga-caaacatagtctccgtttaaatat
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64
721 6 71 F 724 39 143 1343 34 95.29
cgcgaangaagggtaccttgtgnangacnnnncttctttnggtgctganatcttcatgcgntancccgac
|||||| ||||||||||||||| | |||    ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||
cgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcat-cgttaacccgac
agaaanacnnnananagtcncattcatatcnnaccctccnaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
||||| ||   | | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagattag
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctngttggagaccgatactggagactag
gatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaata
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaata
taatattgatgtcagagctaaaagatgcatccaaaagggtatatggtgaatgatgccattatctttgaag
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taatattgatgtcagagctaaaagatgcatc-aaaagggtatatggtgaatgatgccattatctttgaag
ctgaaatggttaaggtctctgtgacaaacatagtctccgtttaaatatcactacttctttttcaacaaca
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ctgaaatggttaaggtctctgtgacaaacatagtctccgtttaaatatcactacttctttttcaacaaca
accttacgaataaagtggactttgatgagtttaatttgttatacgacaacgttgttgatgcttgtgatgt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
accttacgaataaagtggactttgatgagtttaatttgttatacgacaacgttgttgatgcttgtgatgt
aatcgttgtttctgctctccgagttttcgttttactttttttttcatgttttgctatc-aatgaaa-taa
 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
natcgttgtttctgctctccgagttttcgttttactttttttttcatgttttgctatccaatgaaaataa
a-ggtataaaactctc-tt-ggtttt
| ||| |||||||||| || ||||||
aaggtttaaaactctcctttggtttt
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 31/64
581 2 45 F 600 5 11 1010 57 90.35
aaatatttgactgttacagatggcttagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggac
||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||  ||
aaatatttgtctgttacagatggaacagtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacac
aattgattcctcgat-caacattctacaacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttg
|||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||
aattgatttctc-ttccaacattctacaacgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttg
gtgctgagatctttattgttaaaccggctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaa
||||||||||||| || ||||| ||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
gtgctgagatcttcatcgttaacccgacagaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaga
caatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatttt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
caatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatttt
ctcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcac
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ctcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcac
ttccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaa
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
ttccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaacgcagttgctacaaacacttggggagcggttaa
tctgcggttaaagaatcaacgaanttctaaccatagacaa-tatnt-ctgca-cttggtaccc-attgga
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||
tctgcggttaaagaatcaacgaagtactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattgga
aacg-ttatggtntgggant-aaca-tatc-tactgtt-gctgatt-aa-cga-gcatccaaaggat-tt
| || ||||||| ||||| | |||| |||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||| ||
agcggttatggtgtgggagtgaacaatatcatactgttagctgatttaaacgatgcatcaaaaggatatt
tggtga-tga-gccnt-atctt-gaa-ctgaa-tggttaag
|||||| ||| ||| | ||||| ||| ||||| ||||||||
tggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaag
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64
547 2 0 F 552 39 0 943 52 90.54
gtgantgttgatctcaaactctttgtccataatgggaagctacacaaatatttgactgttacagatggct
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
gtgaatgttgatctcaaactctttgtccataatgggaagctacacaaatatttgactgttacagatggaa
tagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggacaattgattcctcgat-caacattct
 |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||  |||||||||| |||  | |||||||||
cagtgaagcgatacaacgatgcnaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctc-ttccaacattct
acaacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttggtgctgagatctttattgttaaacc
|||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||
acaacgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaaccc
ggctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatactt
| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gacagaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatactt
cgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgattttctcgttgaagaccgatactggagac
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||
cgtttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctngttggagaccgatactggagac
taggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatttgctcaagg
|||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
taggatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaagg
ccataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaant
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
ccataaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagc
tctaaccatagacaat-atnt-ctgca-cttggtaccc-attggaaacg-ttatggtntggga
|| ||||| | ||||| || | ||||| |||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||
tccaaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcgaagcgattatggtgtggga
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/63
680 16 84 F 680 39 0 1168 64 90.59
gtgaatgttgatctcaaactctttgtccataatgggaagctacacaaatatttgactgttacagatggct
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
gtgaatgttgatctcaaactctttgtccataatgggaagctacacaaatatttgactgttacagatggaa
tagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggacaattgattcctcgat-caacattct
 |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||  |||||||||| |||  | |||||||||
cagtgaagcgatacaacgatgcnaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctc-ttccaacattct
acaacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttggtgctgagatctttattgttaaacc
|||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||
acaacgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaaccc
ggctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatactt
| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gacagaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatactt
cgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatnttctcgttgaagaccgatactggagac
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||
cgtttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctngttggagaccgatactggagac
taggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatttgctcaagg
|||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
taggatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaagg
ccataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaag-
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
ccataaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagc
tactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattggaaacggttatggtgtgggagtgaac
| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||
tcc-aaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaac
aatatcatactgttag-ctgatttaaacgatgcatccaaaggatatttggtgaatgatgccattatcttt
||||| ||| || | | | ||  |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||
aatataatattgat-gtcagagctaaaagatgcatcaaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttt
gaagctgaaatggttaaggtctctataaccaacatcgtctccgcttaaatatc
|||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||
gaagctgaaatggttaaggtctctgtgacaaacatagtctccgtttaaatatc
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64
721 6 71 F 724 39 143 1343 34 95.29
cgcgaangaagggtaccttgtgnangacnnnncttctttnggtgctganatcttcatgcgntancccgac
|||||| ||||||||||||||| | |||    ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||
cgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcat-cgttaacccgac
agaaanacnnnananagtcncattcatatcnnaccctccnaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
||||| ||   | | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagattag
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctngttggagaccgatactggagactag
gatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaata
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaata
taatattgatgtcagagctaaaagatgcatccaaaagggtatatggtgaatgatgccattatctttgaag
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taatattgatgtcagagctaaaagatgcatc-aaaagggtatatggtgaatgatgccattatctttgaag
ctgaaatggttaaggtctctgtgacaaacatagtctccgtttaaatatcactacttctttttcaacaaca
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ctgaaatggttaaggtctctgtgacaaacatagtctccgtttaaatatcactacttctttttcaacaaca
accttacgaataaagtggactttgatgagtttaatttgttatacgacaacgttgttgatgcttgtgatgt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
accttacgaataaagtggactttgatgagtttaatttgttatacgacaacgttgttgatgcttgtgatgt
aatcgttgtttctgctctccgagttttcgttttactttttttttcatgttttgctatc-aatgaaa-taa
 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
natcgttgtttctgctctccgagttttcgttttactttttttttcatgttttgctatccaatgaaaataa
a-ggtataaaactctc-tt-ggtttt
| ||| |||||||||| || ||||||
aaggtttaaaactctcctttggtttt
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 31/64
610 3 0 F 607 39 72 1163 18 97.04
gtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gtgaagcgatacaacgatgcnaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
acgcgaacgaagggtacnttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
acgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccgaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagattag
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctngttggagaccgatactggagactag
gatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaat
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccc-gattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaat
atcatattgatgtcagaagctaaaagatgcatcnaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttttga
|| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
ataatattgatgtcaga-gctaaaagatgcatcaaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttt-ga
aactgaaatggttaaggtctctgtgaacaa-catantctccncttaaatat
| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||
agctgaaatggttaaggtctctgtga-caaacatagtctccgtttaaatat
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64
721 6 71 F 724 39 143 1343 34 95.29
cgcgaangaagggtaccttgtgnangacnnnncttctttnggtgctganatcttcatgcgntancccgac
|||||| ||||||||||||||| | |||    ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||
cgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcat-cgttaacccgac
agaaanacnnnananagtcncattcatatcnnaccctccnaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
||||| ||   | | |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagattag
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctngttggagaccgatactggagactag
gatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaata
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtacccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaata
taatattgatgtcagagctaaaagatgcatccaaaagggtatatggtgaatgatgccattatctttgaag
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taatattgatgtcagagctaaaagatgcat-caaaagggtatatggtgaatgatgccattatctttgaag
ctgaaatggttaaggtctctgtgacaaacatagtctccgtttaaatatcactacttctttttcaacaaca
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ctgaaatggttaaggtctctgtgacaaacatagtctccgtttaaatatcactacttctttttcaacaaca
accttacgaataaagtggactttgatgagtttaatttgttatacgacaacgttgttgatgcttgtgatgt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
accttacgaataaagtggactttgatgagtttaatttgttatacgacaacgttgttgatgcttgtgatgt
aatcgttgtttctgctctccgagttttcgttttactttttttttcatgttttgctatc-aatgaaa-taa
 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
natcgttgtttctgctctccgagttttcgttttactttttttttcatgttttgctatccaatgaaaataa
a-ggtataaaactctc-tt-ggtttt
| ||| |||||||||| || ||||||
aaggtttaaaactctcctttggtttt
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 31/64
517 64 0 F 517 65 0 1034 0 100.00
cacgaaagtcttacgcgtctccttgaagatgcgaaatctattattgagaaatattggaaactcagatgga
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cacgaaagtcttacgcgtctccttgaagatgcgaaatctattattgagaaatattggaaactcagatgga
gcagacacgtttgcaggaagtacaggtacatcaaaaaactcgaatcgatagaacttgaattagtaagggt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gcagacacgtttgcaggaagtacaggtacatcaaaaaactcgaatcgatagaacttgaattagtaagggt
agcacgtgagatacaagtccaccaatggaccgatatcaaagaaatgaaggcgatacaagtccaccaatgg
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
agcacgtgagatacaagtccaccaatggaccgatatcaaagaaatgaaggcgatacaagtccaccaatgg
accgatatcaaagaaatgaaggcgatacaagtcgaccaatggaccgatatcaaagaaatgaaggcgatac
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
accgatatcaaagaaatgaaggcgatacaagtcgaccaatggaccgatatcaaagaaatgaaggcgatac
aagtcgaccaatggatcgatatcaaagaaatgaaggcgatacaagtcgaccaatggaccgatatcaaaga
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aagtcgaccaatggatcgatatcaaagaaatgaaggcgatacaagtcgaccaatggaccgatatcaaaga
aatgaaggccagatatctgaaaagcataataaatgaatcaatatctaaaatctggtgtttttctctcttt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aatgaaggccagatatctgaaaagcataataaatgaatcaatatctaaaatctggtgtttttctctcttt
cttcttccccacaatgattgaaaaactcttcttgttatgaataaagatggatgcccatttataagggcca
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cttcttccccacaatgattgaaaaactcttcttgttatgaataaagatggatgcccatttataagggcca
tcatctaagcccatcatctagattttt
|||||||||||||||||||||||||||
tcatctaagcccatcatctagattttt
537 474 3 F 520 658 82 973 28 94.70
aggttgcccccaatcggaagagaagttgngcnctttcttcctccctgccnttagtgccgttgaattggct
|||||| |||| |||||||||||| |||  | | |||||||| |||  | |||||| || || |||||||
aggttg-cccc-atcggaagagaanttgaactc-ttcttcct-cctnnc-ttagtgacg-tg-attggct
aaggaagttg-cttccttctccgcaacaagtggatcccttgtgttgaattcgagttggagcaccggattn
||||||| || | ||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| 
aaggaag-tgac-tccttctccgc-ac-agtggattcc-tgtgttg-attcgagttggagca-cggattt
gtgtaccgtgagcacggaaccactcccggatactatgatggacggtactggacaatgtggaagcttccat
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
gtgtaccgtgagcacggaa-cactcccggatactatgatggacggtactggacaatgtgg-agcttccat
tggttcggatgcaccgactccgctcaagtgttgaaggaagttgaagaatgcaagaaggagtaccctggcg
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
t-gttcggatgcaccgactccgctcaagtgttgaaggaagttgaagaatgcaagaaggagta-cctggcg
ccttcattaggatcatcggattcgacaacacccgtcaagtccaatgcatcagtttcattgcctacaagcc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ccttcattaggatcatcggattcgacaacacccgtcaagtccaatgcatcagtttcattgcctacaagcc
cccaagcttcaccgaagcttaatcccctttctggaatattcagcgttgattattctggaacccatttcta
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cccaagcttcaccgaagcttaatcccctttctggaatattcagcgttgattattctggaacccatttcta
tgtggtcaatgcaaatttaagaaattatttgccgacttaaaagttgaggaactattgtttgaaagtgaaa
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tgtggtcaatgcaaatttaagaaattatttgccgacttaaaagttgaggaactattgtttgaaagtgaaa
atgttattcctatcagtttctctataattatagttatcatttcatttc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
atgttattcctatcagtttctctataattatagttatcatttcatttc
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 33/64, seed_on_end
728 5 11 F 732 16 129 1307 51 93.01
aaatatttgtctgttacagatggaacagtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacac
||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||  ||
aaatatttgactgttacagatggcttagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggac
aattgatttctc-ttccaacattctacaacgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttg
|||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||
aattgattcctcgat-caacattctacaacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttg
gtgctgagatcttcatcgttaacccgacagaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaga
||||||||||||| || ||||| ||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
gtgctgagatctttattgttaaaccggctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaa
caatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatttt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
caatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatntt
ctcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcac
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ctcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcac
ttccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaacgcagttgctacaaacacttggggagcggttaa
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
ttccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaa
tctgcggttaaagaatcaacgaagtactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattgga
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tctgcggttaaagaatcaacgaagtactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattgga
agcggttatggtgtgggagtgaacaatatcatactgttagctgatttaaacgatgcatcaaaaggatatt
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
aacggttatggtgtgggagtgaacaatatcatactgttagctgatttaaacgatgcatccaaaggatatt
tggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaaggtctctataaccaacatcgtctccgctta
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaaggtctctataaccaacatcgtctccgctta
aatatctgcacttctttgtctacgatcaatcaaccttatgaataaagagatatttgat--ga-g--tttg
||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||| ||  || |  ||||
aatatctgcncttctttgtctacnancaatccaccttatgaataaaaaaat-tttaatttgatgaatttg
taataagaaaacgttaatgtttgtgaattgtgaa
| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||
ttataanaaaactttaatgtttgttaaatgtgaa
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/45
582 3 0 F 579 5 38 1056 35 93.97
gtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
acgcgaacgaagggtacnttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
acgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctcc-gaacaatgttttcacttggaagatacttcg
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaga-caatgttttcacttggaagatacttcg
tttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagatta
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
tttctctaccttggaagataaattctattactccgatgattttctcgttgaagaccgatactggagacta
ggatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcc
|||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
ggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatttgctcaaggcc
ataaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctc
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 
ataaggcaaacgcagttgctacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaag-ta
c-aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaaca
| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||
ctaaccatagacaaatatattctgcagcttggtaccc-gattggaagcggttatggtgtgggagtgaaca
atatcatattgat-gtcagaagctaaaagatgcatcnaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttt
|||||||| || | | | ||   |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||
atatcatactgttag-ctgatt-taaacgatgcatcaaaaggatatttggtgaatgatgccattatcttt
tgaaactgaaatggttaaggtctct
 ||| ||||||||||||||||||||
-gaagctgaaatggttaaggtctct
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64, seed_on_start
626 2 0 F 645 16 84 1190 27 95.75
gtgantgttgatctcaaactctttgtccataatgggaagctacacaaatatttgactgttacagatggct
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gtgaatgttgatctcaaactctttgtccataatgggaagctacacaaatatttgactgttacagatggct
tagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggacaattgattcctcgatcaacattcta
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggacaattgattcctcgatcaacattcta
caacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttggtgctgagatctttattgttaaaccg
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
caacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttggtgctgagatctttattgttaaaccg
gctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttc
gtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgattttctcgttgaagaccgatactggagact
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
gtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatnttctcgttgaagaccgatactggagact
aggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatttgctcaaggc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatttgctcaaggc
cataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaantt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 
cataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagta
ctaaccatagacaa-tatnt-ctgca-cttggtaccc-attggaaacg-ttatggtntgggant-aaca-
|||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||| 
ctaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattggaaacggttatggtgtgggagtgaacaa
tatc-tactgtt-gctgatt-aa-cga-gcatccaaaggat-tttggtga-tga-gccnt-atctt-gaa
|||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||| |||
tatcatactgttagctgatttaaacgatgcatccaaaggatatttggtgaatgatgccattatctttgaa
-ctgaa-tggttaag
 ||||| ||||||||
gctgaaatggttaag
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64, seed_on_start
626 2 0 F 645 16 84 1190 27 95.75
gtgantgttgatctcaaactctttgtccataatgggaagctacacaaatatttgactgttacagatggct
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gtgaatgttgatctcaaactctttgtccataatgggaagctacacaaatatttgactgttacagatggct
tagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggacaattgattcctcgatcaacattcta
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggacaattgattcctcgatcaacattcta
caacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttggtgctgagatctttattgttaaaccg
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
caacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttggtgctgagatctttattgttaaaccg
gctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttc
gtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgattttctcgttgaagaccgatactggagact
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
gtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatnttctcgttgaagaccgatactggagact
aggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatttgctcaaggc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatttgctcaaggc
cataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaantt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 
cataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagta
ctaaccatagacaa-tatnt-ctgca-cttggtaccc-attggaaacg-ttatggtntgggant-aaca-
|||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||| 
ctaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattggaaacggttatggtgtgggagtgaacaa
tatc-tactgtt-gctgatt-aa-cga-gcatccaaaggat-tttggtga-tga-gccnt-atctt-gaa
|||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||| |||
tatcatactgttagctgatttaaacgatgcatccaaaggatatttggtgaatgatgccattatctttgaa
-ctgaa-tggttaag
 ||||| ||||||||
gctgaaatggttaag
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64
728 5 11 F 732 16 129 1307 51 93.01
aaatatttgtctgttacagatggaacagtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacac
||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||  ||
aaatatttgactgttacagatggcttagtgaagcgatataacaatgcgaaaaaagaatggggtttcggac
aattgatttctc-ttccaacattctacaacgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttg
|||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||
aattgattcctcgat-caacattctacaacgcgaacgaaggttaccttgaccaggacactggttcttttg
gtgctgagatcttcatcgttaacccgacagaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaga
||||||||||||| || ||||| ||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
gtgctgagatctttattgttaaaccggctcaacaacaagagaaagttacattcatatcaaaccctccaaa
caatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatttt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
caatgttttcacttggaagatacttcgtttctctaccttggaagataaattctattactccgatgatntt
ctcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcac
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ctcgttgaagaccgatactggagactaggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcac
ttccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaacgcagttgctacaaacacttggggagcggttaa
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
ttccaatcttcctatttgctcaaggccataaggcaaatgcagttgctacaaacacttggggagcggttaa
tctgcggttaaagaatcaacgaagtactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattgga
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tctgcggttaaagaatcaacgaagtactaaccatagacaaatatattctgcagcttggtacccgattgga
agcggttatggtgtgggagtgaacaatatcatactgttagctgatttaaacgatgcatcaaaaggatatt
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
aacggttatggtgtgggagtgaacaatatcatactgttagctgatttaaacgatgcatccaaaggatatt
tggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaaggtctctataaccaacatcgtctccgctta
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
tggtgaatgatgccattatctttgaagctgaaatggttaaggtctctataaccaacatcgtctccgctta
aatatctgcacttctttgtctacgatcaatcaaccttatgaataaagagatatttgat--ga-g--tttg
||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||| ||  || |  ||||
aatatctgcncttctttgtctacnancaatccaccttatgaataaaaaaat-tttaatttgatgaatttg
taataagaaaacgttaatgtttgtgaattgtgaa
| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||
ttataanaaaactttaatgtttgttaaatgtgaa
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/45
610 3 0 F 607 39 72 1163 18 97.04
gtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gtgaagcgatacaacgatgcnaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
acgcgaacgaagggtacnttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
acgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccgaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaaacaatgttttcacttggaagatacttcgt
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagattag
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||
ttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctngttggagaccgatactggagactag
gatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gatttaacccgaaaggatctggtggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcca
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
taaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctcc
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaat
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccc-gattcgaagcgattatggtgtgggagtgaacaat
atcatattgatgtcagaagctaaaagatgcatcnaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttttga
|| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
ataatattgatgtcaga-gctaaaagatgcatcaaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttt-ga
aactgaaatggttaaggtctctgtgaacaa-catantctccncttaaatat
| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||
agctgaaatggttaaggtctctgtga-caaacatagtctccgtttaaatat
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64
582 3 0 F 579 5 38 1056 35 93.97
gtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gtgaagcgatacaacgatgcaaaaaaagagtggggattcacacaattgatttctcttccaacattctaca
acgcgaacgaagggtacnttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
acgcgaacgaagggtaccttgtgcaggacacagcttcttttggtgctgagatcttcatcgttaacccgac
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctcc-gaacaatgttttcacttggaagatacttcg
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
agaaaaacaagagaaagtcacattcatatcaaaccctccaga-caatgttttcacttggaagatacttcg
tttctctaccttggaagataaattctattactctgatgattttctcgttgaagaccgatactggagatta
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
tttctctaccttggaagataaattctattactccgatgattttctcgttgaagaccgatactggagacta
ggatttaacccgaaaggatctggtggagggagaccacatgcacttccaatcttcctatatgctcaaggcc
|||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
ggatttaacccgaaaggggatggaggaggaagaccacatgcacttccaatcttcctatttgctcaaggcc
ataaggcaaacgcagttgttacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaagctc
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | 
ataaggcaaacgcagttgctacaaacacttggggagcggttaatctgcggttaaagaatcaacgaag-ta
c-aaccacaaacaattatattctgcagcttggtaccccgattcgaagcgattatggtgtgggagtgaaca
| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||
ctaaccatagacaaatatattctgcagcttggtaccc-gattggaagcggttatggtgtgggagtgaaca
atatcatattgat-gtcagaagctaaaagatgcatcnaaagggtatatggtgaatgatgccattatcttt
|||||||| || | | | ||   |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||
atatcatactgttag-ctgatt-taaacgatgcatcaaaaggatatttggtgaatgatgccattatcttt
tgaaactgaaatggttaaggtctct
 ||| ||||||||||||||||||||
-gaagctgaaatggttaaggtctct
# polishing(m=200,d=-800,p=30): 64/64
